Deux secteurs de risques ont une incidence sur les activités courantes et les principales données de planification pour l'Activité de programme 1.1, Science et technologie pour la santé publique, cernés dans le profil de risque de l'organisation de l'Agence de 2011. Il s'agit des secteurs « maladies infectieuses » et « maladies d'origine alimentaire », qui déterminent grandement de quelle manière l'Agence procède pour réaliser les deux résultats attendus suivants : « Les professionnels de la santé publique ont accès à des services d'analyse de référence fiables et opportuns afin d'appuyer les décisions et interventions en matière de santé publique » et « Les professionnels de la santé publique ont accès à des résultats de recherche et à des renseignements scientifiques afin d'appuyer les décisions et interventions en matière de santé publique ». La réalisation de ces résultats contribuera à atteindre le résultat établi pour le gouvernement du Canada qu'est « Des Canadiens en santé ».